More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3286 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  100 
 
 		 450 aa  914    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  61.59 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.43 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.31 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.05 
 
 		 762 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 635 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 265 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.74 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 232 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  49.15 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.77 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.74 
 
 		 150 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  45.04 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 224 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.16 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  43.22 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  37.16 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  47.41 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  47.41 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  45 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  47.41 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45 
 
 		 234 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.44 
 
 		 181 aa  107  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  39.77 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  42.19 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.4 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.4 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.4 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.4 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.4 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.33 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.4 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.4 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  40.26 
 
 		 212 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 448 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.35 
 
 		 523 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.5 
 
 		 221 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 221 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.5 
 
 		 177 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  48.7 
 
 		 173 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  43.97 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 578 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  43.97 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  40.5 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  43.51 
 
 		 181 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  40.94 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 298 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  34.1 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  43.97 
 
 		 577 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 257 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  43.85 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 177 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 188 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  44.83 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.75 
 
 		 181 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 269 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.35 
 
 		 269 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.27 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.63 
 
 		 226 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 177 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 273 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  42.62 
 
 		 197 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 255 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 177 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  41.84 
 
 		 242 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 575 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  45.3 
 
 		 205 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.37 
 
 		 217 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  41.13 
 
 		 257 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 246 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.9 
 
 		 193 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  42.62 
 
 		 177 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 284 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  36.72 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 278 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  42.64 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  42.64 
 
 		 426 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.64 
 
 		 580 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  42.64 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  44.64 
 
 		 579 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 175 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 177 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>