More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3262 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  44.35 
 
 
901 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  44.35 
 
 
901 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  44.65 
 
 
908 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  46.09 
 
 
897 aa  710    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  47.52 
 
 
873 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  43.61 
 
 
918 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  43.47 
 
 
844 aa  667    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  44.26 
 
 
1010 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  42.67 
 
 
934 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  48.4 
 
 
835 aa  741    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  41.61 
 
 
944 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  43.54 
 
 
862 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  44.87 
 
 
842 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 
908 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0838  preprotein translocase subunit SecA  50.77 
 
 
788 aa  779    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  48.03 
 
 
835 aa  737    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0784  preprotein translocase subunit SecA  49.48 
 
 
787 aa  755    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  48.15 
 
 
835 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0786  preprotein translocase subunit SecA  50.89 
 
 
788 aa  780    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  48.15 
 
 
835 aa  738    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  43.6 
 
 
896 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  43.6 
 
 
896 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  44.09 
 
 
903 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  50.51 
 
 
836 aa  764    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  45.03 
 
 
904 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  43.73 
 
 
968 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  45.22 
 
 
933 aa  666    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  44.83 
 
 
923 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  43.83 
 
 
922 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  45.07 
 
 
903 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  43.75 
 
 
901 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  44.65 
 
 
908 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  45.36 
 
 
896 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  43.34 
 
 
932 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  45.47 
 
 
899 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  44.84 
 
 
864 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  43.53 
 
 
910 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0882  preprotein translocase subunit SecA  50.77 
 
 
788 aa  779    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  48.03 
 
 
835 aa  737    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  46.33 
 
 
787 aa  686    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  44.77 
 
 
909 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  44.66 
 
 
896 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  45.5 
 
 
896 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  42.87 
 
 
930 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  41.35 
 
 
962 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  44.58 
 
 
994 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  43.67 
 
 
862 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  44.63 
 
 
939 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  44.46 
 
 
912 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  46.3 
 
 
894 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  44.58 
 
 
871 aa  688    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  43.23 
 
 
917 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  43.7 
 
 
908 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  44.49 
 
 
843 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  42.93 
 
 
936 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  43.91 
 
 
907 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  44.88 
 
 
912 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  45.33 
 
 
925 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  44.49 
 
 
843 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.42 
 
 
908 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  44.16 
 
 
911 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  43.34 
 
 
932 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 
916 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  45.6 
 
 
902 aa  683    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  43.36 
 
 
909 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  43.29 
 
 
907 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  46.2 
 
 
840 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 
845 aa  683    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  43.9 
 
 
898 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 
908 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  44.53 
 
 
908 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  46.99 
 
 
909 aa  680    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3807  preprotein translocase, SecA subunit  44.57 
 
 
895 aa  652    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0963816  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  46.64 
 
 
830 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  45.62 
 
 
833 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  43.22 
 
 
931 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  44.34 
 
 
916 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  43.56 
 
 
865 aa  662    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1321  protein translocase subunit secA  43.75 
 
 
788 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  47.68 
 
 
799 aa  704    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  44.14 
 
 
912 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  44.43 
 
 
849 aa  663    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 
910 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  43.46 
 
 
932 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  47.31 
 
 
840 aa  705    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  44.16 
 
 
901 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 
908 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  44.28 
 
 
1009 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
931 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  45.62 
 
 
896 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  43.54 
 
 
862 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  43.71 
 
 
908 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0711  preprotein translocase subunit SecA  51.52 
 
 
787 aa  787    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.752674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  44.42 
 
 
908 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>