More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3042 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  100 
 
 
324 aa  658  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  77.02 
 
 
327 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  55.87 
 
 
334 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.52 
 
 
323 aa  337  2e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.68 
 
 
319 aa  326  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.68 
 
 
319 aa  326  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  50.61 
 
 
340 aa  318  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  49.69 
 
 
341 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  46.27 
 
 
322 aa  306  4e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  50.78 
 
 
319 aa  303  2e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  46.44 
 
 
322 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  48.72 
 
 
317 aa  295  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  49.21 
 
 
318 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2722  Glyoxylate reductase  49.68 
 
 
322 aa  288  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  56.98 
 
 
328 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  50.16 
 
 
330 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  50.48 
 
 
320 aa  284  1e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  50.48 
 
 
330 aa  284  2e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  50.48 
 
 
330 aa  284  2e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.84 
 
 
330 aa  283  4e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  49.52 
 
 
320 aa  282  6e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  50.16 
 
 
330 aa  281  8e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  50.16 
 
 
330 aa  281  8e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.56 
 
 
320 aa  281  8e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  50.16 
 
 
330 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.52 
 
 
330 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.95 
 
 
327 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.65 
 
 
326 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  49.07 
 
 
324 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.21 
 
 
320 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.07 
 
 
326 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.2 
 
 
337 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.53 
 
 
323 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.48 
 
 
321 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  49.07 
 
 
324 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  49.07 
 
 
324 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  49.07 
 
 
324 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.63 
 
 
323 aa  274  1e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  50.94 
 
 
327 aa  274  1e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  45.37 
 
 
339 aa  273  2e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  48.76 
 
 
324 aa  273  2e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  51.48 
 
 
274 aa  274  2e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.84 
 
 
324 aa  273  4e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  44.79 
 
 
315 aa  272  7e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.46 
 
 
335 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  49.53 
 
 
324 aa  271  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  48.62 
 
 
325 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.27 
 
 
332 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  49.53 
 
 
324 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  49.53 
 
 
324 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  49.53 
 
 
324 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  49.53 
 
 
324 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.59 
 
 
318 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  50.32 
 
 
324 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  49.53 
 
 
324 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  50.52 
 
 
325 aa  270  3e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  49.53 
 
 
324 aa  270  3e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  49.22 
 
 
324 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.68 
 
 
326 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.68 
 
 
326 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  47.71 
 
 
325 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  47.71 
 
 
325 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.56 
 
 
331 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  47.47 
 
 
316 aa  267  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.63 
 
 
320 aa  266  3e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  47.4 
 
 
325 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  49.04 
 
 
321 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  46.32 
 
 
320 aa  265  6e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.2 
 
 
338 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.35 
 
 
331 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  48.3 
 
 
330 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  46.54 
 
 
319 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.84 
 
 
324 aa  262  5e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.3 
 
 
329 aa  262  7e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  53.58 
 
 
329 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  53.03 
 
 
328 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.48 
 
 
322 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  54.15 
 
 
328 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  47.12 
 
 
322 aa  259  5e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  44.55 
 
 
357 aa  259  5e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2446  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.32 
 
 
334 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  54.09 
 
 
321 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  41.51 
 
 
320 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.53458e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2069  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.99 
 
 
338 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  hitchhiker  0.00440451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  51.89 
 
 
326 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  51.89 
 
 
326 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2144  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.82 
 
 
327 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126393  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  45.51 
 
 
329 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.41 
 
 
345 aa  255  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  46.08 
 
 
348 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.89 
 
 
325 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  54.69 
 
 
321 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.75 
 
 
338 aa  254  1e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.52 
 
 
326 aa  254  1e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3708  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.81 
 
 
327 aa  254  2e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.971324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  47.6 
 
 
321 aa  254  2e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  45.51 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  54.88 
 
 
321 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  45.51 
 
 
352 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  45.51 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>