52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3013 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  100 
 
 		 206 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  56.1 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  57.56 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  55.12 
 
 		 207 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  55.12 
 
 		 207 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  32.56 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  28.42 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.11 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.58 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.9 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  29.95 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.74 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.18 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  27.66 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.93 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.61 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.49 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  26.9 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  28.27 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.49 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  28.42 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.63 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  27.03 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  26.49 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.15 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.07 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  30.67 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  27.89 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  28.4 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  26.53 
 
 		 281 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  26.5 
 
 		 1390 aa  48.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  25.71 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  25.71 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  25.71 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  27.7 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  22.4 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  22.4 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  29.27 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.68 
 
 		 595 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  26.62 
 
 		 281 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  27.82 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  25.27 
 
 		 1367 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  25.27 
 
 		 1367 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>