47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2995 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 293 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  61.36 
 
 		 311 aa  358  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  35.46 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  35.56 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  35.56 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  35.1 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  35.77 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  38.46 
 
 		 178 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.54 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  30.41 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  35.66 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  32.8 
 
 		 190 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  32.8 
 
 		 190 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.29 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  35.11 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  33.81 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  33.09 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.41 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  33.09 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  27.12 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  32.82 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  37.76 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  30.57 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.12 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  34.92 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  23.65 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.45 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  35.24 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.34 
 
 		 200 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  26.98 
 
 		 153 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  29.32 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  33.63 
 
 		 175 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  27.56 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.1 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  24.43 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  34.02 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  24.37 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  30.69 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.48 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.17 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  30.23 
 
 		 191 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>