More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2898 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
375 aa  773    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  64.17 
 
 
376 aa  511  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  64 
 
 
378 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  63.2 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  63.2 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  63.64 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  63.2 
 
 
376 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  63.2 
 
 
376 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  63.1 
 
 
376 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  62.93 
 
 
376 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  63.9 
 
 
378 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  58.97 
 
 
379 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  46.01 
 
 
378 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 
397 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 
403 aa  252  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  38.34 
 
 
393 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 
400 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 
397 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
378 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 
397 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  37.56 
 
 
397 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 
395 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  36.43 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 
376 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
382 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  35.17 
 
 
369 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
389 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  34.73 
 
 
370 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0540  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0596  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
432 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 
244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 
466 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.71 
 
 
251 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 
243 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  38.14 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.65 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 
470 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 
471 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
476 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
467 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.17 
 
 
479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
459 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  31.76 
 
 
244 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.35 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
243 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  33.47 
 
 
455 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.28 
 
 
480 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 
464 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
469 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 
460 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
476 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 
461 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
246 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
246 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
246 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
246 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
462 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.82 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 
459 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
444 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
444 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.9 
 
 
453 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
472 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.03 
 
 
470 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
459 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  30.83 
 
 
472 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
484 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 
466 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
464 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.82 
 
 
456 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
470 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  35.06 
 
 
459 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
617 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 
442 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 
246 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
453 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 
459 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 
459 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
471 aa  99.8  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
489 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 
480 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>