More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2890 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  79.89 
 
 
189 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  62.57 
 
 
201 aa  257  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  60 
 
 
186 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  58.7 
 
 
186 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  59.14 
 
 
186 aa  229  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  58.6 
 
 
186 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  58.6 
 
 
186 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  58.6 
 
 
186 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  58.6 
 
 
186 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  56.22 
 
 
194 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  57.61 
 
 
186 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  56.76 
 
 
186 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  59.46 
 
 
75 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  58.11 
 
 
75 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  51.61 
 
 
130 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  57.89 
 
 
76 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  43.96 
 
 
122 aa  90.5  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  56.58 
 
 
76 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  56.58 
 
 
76 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  56.58 
 
 
76 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 
123 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  56.58 
 
 
76 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 
277 aa  89  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  53.95 
 
 
76 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  50 
 
 
77 aa  87.8  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 
279 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  45.56 
 
 
103 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.09 
 
 
562 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  49.37 
 
 
112 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  51.32 
 
 
282 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  55.71 
 
 
75 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  46.88 
 
 
98 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  53.33 
 
 
75 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  49.37 
 
 
125 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
145 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  54.43 
 
 
110 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
220 aa  84.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  53.25 
 
 
110 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  53.52 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  48.65 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  51.32 
 
 
820 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  45.28 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  51.19 
 
 
356 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  47.3 
 
 
77 aa  82  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  50.65 
 
 
288 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  49.28 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.98 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  47.44 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  48.75 
 
 
108 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  47.62 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  46.67 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  51.9 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  49.3 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  47.44 
 
 
124 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  51.9 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.62 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  40.57 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  46.75 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  47.44 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 
284 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  48.19 
 
 
356 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  48.19 
 
 
356 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  48.91 
 
 
98 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  48.91 
 
 
98 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  46.88 
 
 
98 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  45.95 
 
 
78 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  48.1 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  39.6 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  46.05 
 
 
116 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  46.88 
 
 
98 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 
102 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  38.37 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  41.3 
 
 
106 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  52.11 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  49.35 
 
 
356 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  41.1 
 
 
78 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  47.56 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  48.19 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.74 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
566 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  48.61 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.14 
 
 
566 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>