More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2870 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 443 aa  906    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  60.82 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  57.76 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  55.66 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  56.98 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  56.61 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  56.38 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  55.25 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.92 
 
 		 444 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  56.38 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  55.09 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  54.63 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  55.76 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  53.53 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  54.11 
 
 		 432 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  54.99 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  53.88 
 
 		 432 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  54.17 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  54.11 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  55.22 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  54.21 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  54.23 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  55.22 
 
 		 432 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  53.58 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  53.7 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.95 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  54.97 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  54 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  58.41 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  53.24 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  54.29 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  53.83 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  54.36 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  51.37 
 
 		 432 aa  471  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  52.44 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  51.79 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  52.98 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  51.96 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  51.81 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  55.48 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  52.98 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  54.38 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  51.5 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  52.53 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  52.75 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  52.75 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  52.53 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  53.69 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  52.42 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  51.5 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  51.96 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  54.61 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  51.95 
 
 		 440 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  51.15 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  52.08 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  52.28 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  52.3 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  51.95 
 
 		 440 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  51.95 
 
 		 440 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  51.97 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  50.57 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  51.95 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.27 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  52.3 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  53.23 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  54.15 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  52.21 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  50.11 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  52.18 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  52.76 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  52.41 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  50.46 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  52.4 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  53.15 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  52.53 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  52.39 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  52.3 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  51.72 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  50.46 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  50.81 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  54.73 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  51.61 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  50.34 
 
 		 439 aa  448  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  48.52 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  51.26 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  53.12 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  52.41 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  52.41 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  48.52 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  52.41 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  50.46 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  53.15 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>