More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2864 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
259 aa  261  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.71 
 
 
258 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.55 
 
 
255 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.56 
 
 
266 aa  250  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  47.84 
 
 
257 aa  249  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  47.45 
 
 
257 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.21 
 
 
258 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  51.21 
 
 
258 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
258 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  48.24 
 
 
257 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  51.21 
 
 
258 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.06 
 
 
258 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 
258 aa  238  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 
257 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.66 
 
 
257 aa  237  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
259 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.4 
 
 
258 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
258 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.39 
 
 
258 aa  234  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  45.59 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
257 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
257 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
257 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
257 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
257 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
256 aa  230  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  43.58 
 
 
269 aa  229  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  49.03 
 
 
661 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.35 
 
 
257 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 
257 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 
258 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
257 aa  228  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
258 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.66 
 
 
257 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 
259 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 
258 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
258 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.71 
 
 
258 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  48.37 
 
 
257 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
257 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 
251 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 
258 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
259 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.37 
 
 
266 aa  222  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
258 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.46 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.53 
 
 
257 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
260 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.91 
 
 
662 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.35 
 
 
662 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
257 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
258 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
258 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.12 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
262 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.54 
 
 
259 aa  218  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  46.12 
 
 
257 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.72 
 
 
255 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
259 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  47.54 
 
 
277 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
258 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
259 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.93 
 
 
275 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
236 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  44.71 
 
 
257 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.91 
 
 
262 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
265 aa  216  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.02 
 
 
662 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.84 
 
 
256 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.1 
 
 
257 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.37 
 
 
265 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
258 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
261 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
257 aa  215  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.96 
 
 
257 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
258 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
259 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.99 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.08 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>