62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2859 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 285 aa  593  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  45.32 
 
 		 285 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  40.08 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  34.55 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 272 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  34.63 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  33.71 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  34.96 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  32.23 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  34.96 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  34.96 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  32.83 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  29.87 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  32.59 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  33.96 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  32.37 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  34.94 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  31.15 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  31.66 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  32.27 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  29.69 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  30 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  33.71 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.67 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  30.04 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  30.59 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  26.79 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.02 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  25.48 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  29.08 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  29.71 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  26.67 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  23.51 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  25.29 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  24.81 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  23.64 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  27.19 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  24.78 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  24.78 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  24.78 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1864  PaaX family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  23.11 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2878  putative transcriptional regulator, PaaX family  24.17 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212697  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4282  putative transcriptional regulator, PaaX family  25.16 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.399485  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3784  putative transcriptional regulator, PaaX family  25.19 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0391  putative transcriptional regulator, PaaX family  34.25 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>