More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2781 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  69.57 
 
 
512 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  79.53 
 
 
514 aa  836    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  69.11 
 
 
511 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  100 
 
 
530 aa  1082    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  68.97 
 
 
512 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  67.39 
 
 
512 aa  711    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  68.97 
 
 
512 aa  721    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  52.28 
 
 
513 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  52.08 
 
 
513 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  51.57 
 
 
513 aa  585  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  52.08 
 
 
513 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  51.68 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  51.88 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  51.68 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  51.88 
 
 
513 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  53.09 
 
 
519 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  51.68 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  51.68 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  49.51 
 
 
513 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  49.41 
 
 
511 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  49.21 
 
 
511 aa  547  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  49.21 
 
 
511 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  48.92 
 
 
517 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  48.92 
 
 
517 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  48.62 
 
 
511 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  45.74 
 
 
506 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  47.54 
 
 
512 aa  498  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  46.67 
 
 
518 aa  492  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  41.98 
 
 
499 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  46.02 
 
 
524 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  41.06 
 
 
509 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  42.97 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  39.21 
 
 
509 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  43.85 
 
 
526 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  39.76 
 
 
489 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  40.57 
 
 
486 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  51.37 
 
 
333 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  36.42 
 
 
502 aa  369  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.6 
 
 
495 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.18 
 
 
530 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  39.04 
 
 
476 aa  335  9e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  39.04 
 
 
476 aa  335  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  36.22 
 
 
518 aa  335  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  41.62 
 
 
476 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  41.2 
 
 
513 aa  322  8e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  38.2 
 
 
512 aa  317  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.63 
 
 
509 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  35.69 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  35 
 
 
499 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.67 
 
 
515 aa  300  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  34.07 
 
 
502 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.95 
 
 
501 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.06 
 
 
509 aa  291  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  32.47 
 
 
500 aa  289  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  34.94 
 
 
538 aa  288  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  30.94 
 
 
503 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.86 
 
 
511 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  31.27 
 
 
506 aa  281  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.56 
 
 
492 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.56 
 
 
492 aa  278  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  31.89 
 
 
497 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  30.21 
 
 
519 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  30.6 
 
 
512 aa  270  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.46 
 
 
496 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  28.94 
 
 
505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  31.23 
 
 
506 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.98 
 
 
500 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  33.47 
 
 
508 aa  263  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.72 
 
 
483 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  35 
 
 
472 aa  260  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  33.07 
 
 
514 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  34.13 
 
 
506 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  31.23 
 
 
506 aa  259  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  30.06 
 
 
511 aa  256  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.13 
 
 
504 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  28.51 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.88 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.12 
 
 
490 aa  254  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.15 
 
 
505 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  30.89 
 
 
512 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.27 
 
 
498 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.16 
 
 
499 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  30.02 
 
 
496 aa  249  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  31.05 
 
 
503 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32.21 
 
 
514 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  34.15 
 
 
472 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  34.81 
 
 
483 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  33.79 
 
 
499 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  31.32 
 
 
524 aa  240  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.64 
 
 
489 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.87 
 
 
499 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.09 
 
 
515 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  30.97 
 
 
511 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  33.53 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  33.53 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  33.53 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.91 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  33.53 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  33.53 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  33.53 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>