85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2728 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 848 aa  1738    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  42.86 
 
 		 804 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 		 1143 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  41.58 
 
 		 1112 aa  592  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  42.17 
 
 		 1121 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 		 1121 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 		 1121 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  36.79 
 
 		 1174 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 471 aa  364  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  38.76 
 
 		 471 aa  360  7e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  39.31 
 
 		 707 aa  357  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 		 475 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  39.69 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  40.69 
 
 		 789 aa  351  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.53 
 
 		 810 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  38.31 
 
 		 703 aa  324  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  36.96 
 
 		 488 aa  321  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  35.01 
 
 		 494 aa  303  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  32.95 
 
 		 531 aa  231  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  34.01 
 
 		 581 aa  206  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  48.54 
 
 		 249 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  45.54 
 
 		 251 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.72 
 
 		 472 aa  168  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  41.98 
 
 		 250 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  41.63 
 
 		 247 aa  164  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  42.08 
 
 		 247 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  39.76 
 
 		 258 aa  159  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  42.22 
 
 		 250 aa  159  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  38.28 
 
 		 258 aa  154  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  36.13 
 
 		 250 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 456 aa  99  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.21 
 
 		 357 aa  95.5  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.89 
 
 		 355 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.89 
 
 		 355 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.89 
 
 		 356 aa  88.6  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.84 
 
 		 327 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.95 
 
 		 352 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.2 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  25.12 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  27.5 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  27.5 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  27 
 
 		 741 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.19 
 
 		 315 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  43.68 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  35.04 
 
 		 3320 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  27.85 
 
 		 865 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.81 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.24 
 
 		 829 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.21 
 
 		 4761 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  39.67 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.68 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  29.61 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.07 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  27.39 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.51 
 
 		 846 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  26.75 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.58 
 
 		 341 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  24.49 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.83 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.37 
 
 		 319 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  41.28 
 
 		 926 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  24.05 
 
 		 531 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  27.86 
 
 		 316 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  27.07 
 
 		 307 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.33 
 
 		 334 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 		 537 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  23.36 
 
 		 357 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  27.19 
 
 		 313 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 480 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  26.6 
 
 		 252 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.37 
 
 		 598 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  25.15 
 
 		 718 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  24.66 
 
 		 1306 aa  48.5  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  22.81 
 
 		 1091 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.69 
 
 		 288 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  22.84 
 
 		 1013 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  27.47 
 
 		 3907 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  21.48 
 
 		 393 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.09 
 
 		 599 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.89 
 
 		 1035 aa  45.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  25.35 
 
 		 981 aa  45.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.51 
 
 		 555 aa  44.3  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3020  hypothetical protein  45.95 
 
 		 1250 aa  44.3  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>