84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2720 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  52.4 
 
 
656 aa  692    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  52.7 
 
 
656 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  51.7 
 
 
651 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  51.7 
 
 
651 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  51.85 
 
 
651 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  51.85 
 
 
651 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  52.01 
 
 
651 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  52.13 
 
 
652 aa  697    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  52.16 
 
 
667 aa  687    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  54.69 
 
 
659 aa  694    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
640 aa  1335    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  52.16 
 
 
659 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  46.15 
 
 
646 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  45.64 
 
 
647 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  46.98 
 
 
640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  46.51 
 
 
648 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  45.41 
 
 
648 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  48.53 
 
 
640 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  42.16 
 
 
742 aa  558  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  45.75 
 
 
636 aa  543  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  45.37 
 
 
638 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  46.92 
 
 
640 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  42.7 
 
 
617 aa  501  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  41.51 
 
 
634 aa  495  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  41.89 
 
 
656 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  41.08 
 
 
620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  41.11 
 
 
620 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  38.52 
 
 
800 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  41.58 
 
 
647 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  39.18 
 
 
634 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  37.27 
 
 
666 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  37.37 
 
 
655 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  38.49 
 
 
628 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  35.71 
 
 
648 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  35.11 
 
 
684 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  35.95 
 
 
673 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  36.28 
 
 
672 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  33.9 
 
 
665 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  33.99 
 
 
680 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  36.06 
 
 
629 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  36.38 
 
 
652 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  46.32 
 
 
397 aa  361  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  44.03 
 
 
679 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  32.94 
 
 
686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  35.02 
 
 
643 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  34.29 
 
 
643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  34.4 
 
 
629 aa  303  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  34.98 
 
 
654 aa  290  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  35.08 
 
 
643 aa  290  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  32.17 
 
 
633 aa  266  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  28.37 
 
 
602 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  29.14 
 
 
641 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  25.23 
 
 
844 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  25.96 
 
 
795 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  26.16 
 
 
795 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  25.57 
 
 
760 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.87 
 
 
795 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  29.17 
 
 
607 aa  97.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  27.68 
 
 
711 aa  94.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  23.46 
 
 
955 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  23.88 
 
 
677 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  22.11 
 
 
765 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  26.06 
 
 
783 aa  90.9  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 
838 aa  90.5  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  27.56 
 
 
1025 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.4 
 
 
803 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  22.01 
 
 
678 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  22.09 
 
 
684 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  26.67 
 
 
669 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.72 
 
 
663 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  26.92 
 
 
675 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  24.8 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  26.64 
 
 
963 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  26.1 
 
 
771 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  22.83 
 
 
667 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  23.24 
 
 
792 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  24.51 
 
 
596 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  25.78 
 
 
881 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  25 
 
 
846 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  25.94 
 
 
744 aa  61.6  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  22.67 
 
 
632 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  25.85 
 
 
597 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  25.74 
 
 
749 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0095  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  29.65 
 
 
378 aa  45.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>