141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2710 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
331 aa  692    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  52.24 
 
 
338 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  52.58 
 
 
337 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  48.64 
 
 
366 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  49.39 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  48.77 
 
 
323 aa  335  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  49.23 
 
 
359 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.92 
 
 
697 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  46.55 
 
 
423 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  44.74 
 
 
1478 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  45.86 
 
 
1037 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  46.27 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  44.38 
 
 
689 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  46.45 
 
 
1059 aa  289  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  46.45 
 
 
1059 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  43.03 
 
 
1041 aa  282  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  43.27 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  43.45 
 
 
1020 aa  272  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  42.62 
 
 
407 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  40.95 
 
 
1019 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  39.82 
 
 
1018 aa  249  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  38.35 
 
 
382 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  36.63 
 
 
369 aa  238  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  35.07 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  38.41 
 
 
837 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  37.92 
 
 
1050 aa  215  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  38.1 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  38.28 
 
 
347 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  37.93 
 
 
347 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  38.66 
 
 
912 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  36.63 
 
 
690 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
619 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.41 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  39.06 
 
 
477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  38.44 
 
 
383 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.16 
 
 
491 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  32.43 
 
 
806 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  32.97 
 
 
756 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  36.75 
 
 
317 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  34.73 
 
 
328 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.94 
 
 
474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 
1077 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  37.11 
 
 
457 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  35.36 
 
 
399 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.13 
 
 
1495 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  32.82 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  35.17 
 
 
423 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  35.94 
 
 
1780 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  34.59 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 
678 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  37.72 
 
 
488 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  34.03 
 
 
389 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 
503 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  34.5 
 
 
474 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  37.15 
 
 
495 aa  176  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  36.59 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.57 
 
 
1146 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  33.56 
 
 
487 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.35 
 
 
815 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.78 
 
 
465 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 
451 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.99 
 
 
490 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  35.69 
 
 
394 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  34 
 
 
376 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 
628 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  34.64 
 
 
1215 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  33.56 
 
 
820 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  35.02 
 
 
778 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  37.72 
 
 
829 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  31.58 
 
 
1331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  31.9 
 
 
375 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  32.39 
 
 
497 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  34.19 
 
 
454 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  31.18 
 
 
398 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  35.81 
 
 
457 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  33.02 
 
 
619 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  32.13 
 
 
387 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  34.16 
 
 
388 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  32.59 
 
 
451 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.83 
 
 
472 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  34.26 
 
 
370 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  33.22 
 
 
756 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  34.49 
 
 
1001 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  32.84 
 
 
370 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.36 
 
 
463 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  34.84 
 
 
309 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
368 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  31.14 
 
 
2457 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  32 
 
 
357 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  30.79 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  31.8 
 
 
357 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  32.59 
 
 
401 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 
373 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  30.06 
 
 
486 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  28.62 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  30 
 
 
392 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  27.67 
 
 
561 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  26.61 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  28.31 
 
 
770 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1844  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000515386  hitchhiker  0.000606941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>