143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2695 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
407 aa  840    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  44.35 
 
 
1037 aa  299  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  42.82 
 
 
1018 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  42.62 
 
 
331 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.19 
 
 
697 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  40.49 
 
 
1478 aa  259  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  38.93 
 
 
689 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  39.2 
 
 
366 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  37.19 
 
 
1019 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  39.73 
 
 
1041 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  40.05 
 
 
1059 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  40.05 
 
 
1059 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  39.58 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  40.11 
 
 
338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  39.51 
 
 
359 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  40.45 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  35.99 
 
 
323 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  34.67 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  35.77 
 
 
1020 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  37.82 
 
 
324 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  35.71 
 
 
690 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  34.02 
 
 
374 aa  209  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  36.39 
 
 
912 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  35.82 
 
 
333 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  33.09 
 
 
371 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  36.24 
 
 
477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 
488 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  35.69 
 
 
369 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  35.74 
 
 
382 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  35.93 
 
 
1050 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  36.57 
 
 
491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  35.03 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 
347 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 
837 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  32.93 
 
 
815 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  32.87 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  33.75 
 
 
497 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.55 
 
 
1495 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
678 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.66 
 
 
1146 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  33.52 
 
 
543 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  30.7 
 
 
370 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.46 
 
 
1780 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  32.76 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.23 
 
 
317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  32.51 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.68 
 
 
457 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  33.62 
 
 
383 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  34.49 
 
 
1331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  28.64 
 
 
423 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 
619 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  28.07 
 
 
756 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 
373 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  31.23 
 
 
503 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  32.8 
 
 
829 aa  155  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  30.81 
 
 
806 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  32.22 
 
 
399 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  32.66 
 
 
487 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  32.95 
 
 
1215 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  34.6 
 
 
619 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  31.29 
 
 
820 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  32.9 
 
 
778 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 
376 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  31.02 
 
 
1001 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  29.63 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 
1077 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
628 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  31.9 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  31.15 
 
 
490 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  31.51 
 
 
457 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.35 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  30.32 
 
 
398 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  29.72 
 
 
364 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  31.9 
 
 
2457 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  32.27 
 
 
451 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  30.05 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.63 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  29.55 
 
 
756 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  29.29 
 
 
465 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  32.01 
 
 
375 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  30 
 
 
370 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  29.81 
 
 
1242 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  30.72 
 
 
388 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  31.05 
 
 
451 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  28.99 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  29.87 
 
 
357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.93 
 
 
370 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  26.38 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  30.14 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  28.34 
 
 
392 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  27.76 
 
 
520 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.08 
 
 
373 aa  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  29.46 
 
 
357 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  27.8 
 
 
381 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  23.94 
 
 
486 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  25.29 
 
 
566 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  26.38 
 
 
357 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>