120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2525 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
160 aa  320  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  47.37 
 
 
159 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  40.67 
 
 
158 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  40.67 
 
 
158 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  39.33 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  40.67 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  40.4 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  39.33 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  39.1 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  37.42 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  39.87 
 
 
159 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  47.96 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.15 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  37.86 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  32.93 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  34.68 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  30.37 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  36.44 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  26.39 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  24.84 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  37.35 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  38.95 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  30.2 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  32.24 
 
 
203 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  42.25 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  36.63 
 
 
190 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  29.93 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  38.37 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  30.43 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  41.03 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  35.64 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  40.54 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  36.17 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  41.89 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  30.95 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  31.79 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  31.79 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  31.79 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  30.59 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  30.59 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  38.16 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  35.9 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  30.72 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  34.15 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  35.87 
 
 
486 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  34.31 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  39.19 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  29.63 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 
183 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  34.07 
 
 
216 aa  53.9  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  36 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  33.99 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.87 
 
 
549 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  29.13 
 
 
242 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.61 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  36.08 
 
 
174 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  30.19 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  34.21 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1762  hypothetical protein  26.47 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00888497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1491  membrane flanked domain-containing protein  26.47 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  30.38 
 
 
193 aa  50.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  30.93 
 
 
646 aa  50.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  24.2 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  32.18 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  33.85 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  34.07 
 
 
575 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  37.62 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  29.8 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  27.97 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.01 
 
 
579 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 
242 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.57 
 
 
512 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  34.29 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  33.96 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  24.44 
 
 
192 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  32.77 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
547 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.88 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  35 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  30.19 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>