More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2461 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  67.72 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  53.97 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  50.39 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  44.88 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  41.73 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  51.25 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  44.94 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  35.34 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  34.68 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  36.94 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 305 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  34.91 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  31.93 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 129 aa  66.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  34.69 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  31.3 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  34.69 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.74 
 
 		 464 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 498 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>