More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2429 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  100 
 
 
455 aa  899    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  63.09 
 
 
455 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  52.35 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  51.55 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  51.77 
 
 
453 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  51.55 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  51.77 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  51.55 
 
 
452 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  51.55 
 
 
452 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  51.67 
 
 
457 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  51.89 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  52.56 
 
 
452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  51.8 
 
 
452 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  51.55 
 
 
453 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  50.83 
 
 
449 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  40.8 
 
 
449 aa  323  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  40.45 
 
 
466 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  38.55 
 
 
459 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  38.32 
 
 
459 aa  289  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  38.55 
 
 
459 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  37.41 
 
 
458 aa  289  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  38.1 
 
 
459 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  37.87 
 
 
452 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  38.32 
 
 
459 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  38.32 
 
 
459 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  36.12 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  38.32 
 
 
459 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  37.87 
 
 
459 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  37.25 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1224  MATE efflux family protein  38.62 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  37.64 
 
 
459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  37.75 
 
 
453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  37.9 
 
 
461 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  39.73 
 
 
457 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  39.4 
 
 
478 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  36.14 
 
 
456 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  37.16 
 
 
457 aa  279  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  37.42 
 
 
457 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  37.42 
 
 
457 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  37.42 
 
 
457 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  36.3 
 
 
472 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  38.72 
 
 
458 aa  276  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  41.91 
 
 
459 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  35.08 
 
 
456 aa  276  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  37.16 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  35.67 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  37.64 
 
 
453 aa  272  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  38.32 
 
 
457 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  38.32 
 
 
457 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  38.55 
 
 
457 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  38.32 
 
 
457 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  38.32 
 
 
457 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  36.51 
 
 
461 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  37.53 
 
 
457 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  37.53 
 
 
457 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  37.53 
 
 
457 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  37.53 
 
 
457 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  37.53 
 
 
457 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  37.53 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  37.53 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  37.53 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  37.53 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  36.76 
 
 
457 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  38.61 
 
 
475 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  36.22 
 
 
457 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  36.57 
 
 
457 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  36.05 
 
 
457 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  36.09 
 
 
455 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  35.86 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  36.16 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  36.16 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  36.83 
 
 
457 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  35.59 
 
 
480 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  35.57 
 
 
454 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  33.25 
 
 
425 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  34.3 
 
 
464 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  34.75 
 
 
456 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
461 aa  229  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  38.26 
 
 
479 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  33.87 
 
 
441 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  31.78 
 
 
470 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  31.78 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  32.52 
 
 
459 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  31.46 
 
 
471 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  32.59 
 
 
453 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
453 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  31.46 
 
 
471 aa  186  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  32.59 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  32.59 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.14 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  30.02 
 
 
450 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  36.57 
 
 
454 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  32.01 
 
 
451 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  32.2 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  34.13 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.5 
 
 
474 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
457 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  31.95 
 
 
451 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  32.62 
 
 
453 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>