More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2361 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  100 
 
 
307 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  90.23 
 
 
307 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  73.77 
 
 
307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  63.28 
 
 
305 aa  362  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  62.95 
 
 
305 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  63.28 
 
 
305 aa  362  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  63.28 
 
 
305 aa  361  9e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  63.28 
 
 
305 aa  361  9e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  62.62 
 
 
305 aa  360  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  62.62 
 
 
305 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  62.62 
 
 
305 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  62.3 
 
 
305 aa  359  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  62.62 
 
 
305 aa  359  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  62.62 
 
 
305 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.02 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.79 
 
 
310 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.79 
 
 
310 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.13 
 
 
310 aa  325  9e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  52.96 
 
 
312 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  57.14 
 
 
308 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  52.63 
 
 
312 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  52.6 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  56.68 
 
 
309 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  53.95 
 
 
308 aa  315  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  53.9 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  52.43 
 
 
311 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.42 
 
 
308 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  55.52 
 
 
309 aa  308  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  54.75 
 
 
305 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  55.74 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  51.62 
 
 
310 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  55.08 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  51.96 
 
 
304 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.96 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  56.17 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  56.44 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  48.7 
 
 
311 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  49.67 
 
 
303 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  50.98 
 
 
320 aa  298  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  52.6 
 
 
308 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  54.1 
 
 
307 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  52.44 
 
 
311 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  49.02 
 
 
304 aa  295  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  51.97 
 
 
309 aa  293  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  50.99 
 
 
320 aa  292  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  51.96 
 
 
308 aa  292  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  50.97 
 
 
307 aa  292  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  47.06 
 
 
299 aa  291  9e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55.15 
 
 
308 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  50.16 
 
 
300 aa  290  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  51.47 
 
 
317 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  55.48 
 
 
308 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  52.7 
 
 
303 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  53.09 
 
 
310 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  50.5 
 
 
323 aa  288  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.58 
 
 
310 aa  288  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  50.66 
 
 
307 aa  288  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  49.83 
 
 
301 aa  288  8e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  50.17 
 
 
305 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  50.16 
 
 
317 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  50.83 
 
 
321 aa  287  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  50.81 
 
 
310 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  55.08 
 
 
307 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  50 
 
 
309 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  48.37 
 
 
307 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  50.97 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  52.43 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  50.97 
 
 
309 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  48.71 
 
 
319 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  49.83 
 
 
305 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  50.16 
 
 
317 aa  285  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  51.3 
 
 
309 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  48.5 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.27 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  50.98 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  50.5 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  50.65 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  54.75 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  46.73 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  52.1 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  49.35 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  48.37 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  54.43 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  54.43 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  54.43 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  52.77 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  54.43 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  49.52 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  54.43 
 
 
307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  50.17 
 
 
305 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  54.1 
 
 
307 aa  281  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  50.32 
 
 
307 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  50.34 
 
 
306 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  49.84 
 
 
322 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  51.62 
 
 
309 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  49.83 
 
 
305 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  45.54 
 
 
315 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  54.1 
 
 
307 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  51.46 
 
 
309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  54.1 
 
 
307 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>