More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2278 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 739 aa  1536    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  43.46 
 
 		 740 aa  660    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  20.45 
 
 		 619 aa  108  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 558 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.48 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 563 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.9 
 
 		 562 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.34 
 
 		 404 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  21.93 
 
 		 614 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  25.75 
 
 		 408 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 553 aa  91.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  25.27 
 
 		 518 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 537 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  26.11 
 
 		 525 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  24.48 
 
 		 525 aa  89  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  21.57 
 
 		 407 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  25.17 
 
 		 425 aa  88.6  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 390 aa  87  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  22.33 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  21.66 
 
 		 637 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  20.25 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  22.72 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  20.62 
 
 		 616 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.08 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 659 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  34.29 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  22.83 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  22.96 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 305 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.92 
 
 		 542 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  23.81 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  21.58 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  34.33 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  20.75 
 
 		 627 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.17 
 
 		 609 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  21.78 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  23.84 
 
 		 311 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  31.69 
 
 		 364 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  23.36 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  22.71 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.71 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  18.67 
 
 		 616 aa  72  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  21.62 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  19.97 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  19.83 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  17.92 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  34.69 
 
 		 442 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  21.77 
 
 		 647 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  33.79 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.41 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 405 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  20.96 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  19.71 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  24.65 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.08 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  23.94 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  31.21 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  26.09 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  38.75 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.36 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  18.64 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  27.17 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  30.28 
 
 		 705 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.12 
 
 		 1017 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  27.17 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  31.73 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  26.43 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.42 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.45 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  26.74 
 
 		 412 aa  62  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  18.65 
 
 		 600 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  30.28 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  27.17 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  30.62 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.29 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.63 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  26.47 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  25.85 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  26.6 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>