More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2264 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  100 
 
 
324 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  84.88 
 
 
324 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  66.35 
 
 
321 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  65.02 
 
 
322 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  66.35 
 
 
321 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  65.02 
 
 
322 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  64.71 
 
 
321 aa  421  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  64.71 
 
 
321 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  64.09 
 
 
321 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  64.71 
 
 
321 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  64.4 
 
 
321 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  65.02 
 
 
322 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  58.2 
 
 
305 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  54.94 
 
 
321 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  55.73 
 
 
320 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  56.52 
 
 
320 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  55.03 
 
 
320 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  55.35 
 
 
320 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  54.72 
 
 
320 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  55.03 
 
 
320 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  55.03 
 
 
320 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  53.7 
 
 
320 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  55.97 
 
 
316 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  59.49 
 
 
306 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  55.64 
 
 
298 aa  332  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  40.24 
 
 
662 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  44.6 
 
 
319 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  41.16 
 
 
300 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  38.11 
 
 
313 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  41.13 
 
 
310 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  38.11 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  37.1 
 
 
309 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  37.8 
 
 
330 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  37.8 
 
 
330 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  37.98 
 
 
308 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  32.52 
 
 
340 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  35.56 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  34.08 
 
 
331 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  37.68 
 
 
346 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  35.69 
 
 
336 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  37.06 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  31.23 
 
 
348 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  31.06 
 
 
272 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  28.78 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  32.11 
 
 
333 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  33.44 
 
 
314 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  33.13 
 
 
314 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  32.82 
 
 
314 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  29.54 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  32.82 
 
 
314 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.82 
 
 
314 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.82 
 
 
314 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  32.82 
 
 
314 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  32.82 
 
 
314 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  32.42 
 
 
315 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  33.63 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  32.33 
 
 
312 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.97 
 
 
331 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.23 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.93 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.93 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.93 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.93 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.93 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.53 
 
 
312 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.53 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  30 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  30 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.63 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
324 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
319 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  29.71 
 
 
305 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.41 
 
 
324 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.43 
 
 
326 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.41 
 
 
324 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
358 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.41 
 
 
324 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.09 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.09 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.09 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
380 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
306 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  31.51 
 
 
313 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
353 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
353 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  28.48 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  28.53 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  28.53 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  31.29 
 
 
311 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
316 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.64 
 
 
307 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  26 
 
 
305 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
312 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.62 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  29.32 
 
 
365 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  26.47 
 
 
309 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
405 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>