237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2216 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  75.61 
 
 
537 aa  840    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 
542 aa  1121    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.14 
 
 
558 aa  137  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.93 
 
 
562 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.5 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.19 
 
 
509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  23.95 
 
 
536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.24 
 
 
553 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  21.2 
 
 
575 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  22.04 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  21.52 
 
 
534 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  21.38 
 
 
537 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  20.97 
 
 
546 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  22.78 
 
 
585 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  28.96 
 
 
566 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  27.64 
 
 
536 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  22.44 
 
 
520 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  27.73 
 
 
557 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
586 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
535 aa  98.6  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.9 
 
 
596 aa  94  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  27.38 
 
 
543 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  20.15 
 
 
525 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  23.08 
 
 
493 aa  87  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  20.97 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  26.76 
 
 
539 aa  83.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.07 
 
 
236 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  20.47 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.92 
 
 
739 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  20.21 
 
 
525 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  24.6 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  32 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  20.49 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  19.92 
 
 
505 aa  77  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  20.81 
 
 
523 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  25.62 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  33.93 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  32.46 
 
 
532 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  22.69 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  19.96 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  28.12 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.49 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  20.42 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  28.17 
 
 
705 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  27.01 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  25.34 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  20.33 
 
 
535 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  22.22 
 
 
519 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  32.58 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  29.37 
 
 
530 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  29.25 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  23.81 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
549 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  29.25 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  29.25 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.58 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.17 
 
 
740 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  26.29 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  32.69 
 
 
515 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  24.17 
 
 
512 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  28.28 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  30.58 
 
 
538 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.43 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.99 
 
 
399 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  27.08 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  27.81 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.27 
 
 
601 aa  62.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.47 
 
 
486 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  23.98 
 
 
481 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  24.31 
 
 
400 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  27.21 
 
 
647 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  23.98 
 
 
410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  23.98 
 
 
410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  23.98 
 
 
410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.98 
 
 
410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.98 
 
 
410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.98 
 
 
410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  23.98 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.31 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  25.19 
 
 
485 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  29.11 
 
 
383 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  28.23 
 
 
618 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  25 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  28.06 
 
 
442 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  25.71 
 
 
402 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 
523 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  25.58 
 
 
389 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.82 
 
 
407 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>