More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2197 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  80.2 
 
 		 102 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  53.93 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  56.99 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  49.49 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  49.49 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  56.47 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  48.91 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 117 aa  93.2  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  45.92 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  49.44 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  48.89 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  46.07 
 
 		 120 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  49.4 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  47.19 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  44.94 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  42.7 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  42.7 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  44.32 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  44.32 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  44.94 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  48.15 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  42.39 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1075  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>