More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2133 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  47.31 
 
 
891 aa  807    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  47.31 
 
 
891 aa  806    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  47.31 
 
 
891 aa  808    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  47.42 
 
 
891 aa  810    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  100 
 
 
892 aa  1840    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  47.31 
 
 
891 aa  807    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  47.09 
 
 
891 aa  802    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  47.56 
 
 
897 aa  803    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  39.76 
 
 
901 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  47.31 
 
 
891 aa  807    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  47.32 
 
 
892 aa  795    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  47.2 
 
 
891 aa  801    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  36.84 
 
 
977 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  58.82 
 
 
358 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  28.82 
 
 
906 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  39.52 
 
 
550 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28.9 
 
 
915 aa  356  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  28.88 
 
 
932 aa  334  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  28.05 
 
 
932 aa  318  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  28.13 
 
 
932 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  27.92 
 
 
932 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  28.05 
 
 
932 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  29.78 
 
 
880 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  29.28 
 
 
921 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.28 
 
 
921 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  29.38 
 
 
909 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.22 
 
 
921 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.84 
 
 
437 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  40.81 
 
 
869 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41690  Sigma54-dependent transcriptional activator protein, AcoR  35.71 
 
 
613 aa  124  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3590  helix-turn-helix, Fis-type  38.57 
 
 
436 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  34.4 
 
 
452 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.67 
 
 
461 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.81 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.78 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2117  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.04 
 
 
459 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2324  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
459 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2144  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
461 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0596  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.78 
 
 
617 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2082  arginine utilization regulatory protein  35.81 
 
 
461 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2078  arginine utilization regulatory protein  35.81 
 
 
461 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2299  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
461 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2407  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
459 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.830853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.02 
 
 
480 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0545  arginine utilization regulatory protein RocR  30.71 
 
 
467 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.660554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2333  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
461 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3043  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
477 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.585344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.02 
 
 
480 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5051  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.71 
 
 
460 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610108  normal  0.479337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2280  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
459 aa  111  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4695  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.02 
 
 
480 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1136  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.96 
 
 
466 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.42 
 
 
503 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2633  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.53 
 
 
467 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0702  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.32 
 
 
460 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4752  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.82 
 
 
477 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.102519  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4379  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  34.69 
 
 
516 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5524  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.1 
 
 
640 aa  110  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.92 
 
 
763 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0737  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.11 
 
 
479 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000126889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0941  transcriptional regulator AcoR  34.13 
 
 
625 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1028  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 
642 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.32 
 
 
461 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.26 
 
 
635 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0356  putative two component response regulator  31.37 
 
 
492 aa  108  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1734  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  33.47 
 
 
682 aa  108  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.32 
 
 
467 aa  108  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5076  helix-turn-helix, Fis-type  32.16 
 
 
467 aa  107  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1170  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.46 
 
 
481 aa  107  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3376  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.88 
 
 
466 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1030  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.17 
 
 
457 aa  107  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255246  normal  0.215891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.41 
 
 
1139 aa  107  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10290  transcriptional regulator AcoR  33.73 
 
 
625 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153743  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1866  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.22 
 
 
639 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102196  hitchhiker  0.00350069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0464  arginine utilization regulatory protein RocR  30.36 
 
 
467 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0403  arginine utilization regulatory protein  35.81 
 
 
467 aa  107  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0831  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  37.33 
 
 
518 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0846  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  36 
 
 
518 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.615084  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0489  arginine utilization regulatory protein RocR  30.36 
 
 
467 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0676  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.14 
 
 
456 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  34.07 
 
 
510 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.88 
 
 
473 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1431  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.45 
 
 
638 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0267113  decreased coverage  0.00146608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0807  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  36.44 
 
 
518 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5030  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.06 
 
 
449 aa  106  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2603  putative regulatory protein  35.38 
 
 
475 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1122  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.17 
 
 
457 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2503  putative regulatory protein  35.38 
 
 
475 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5443  two-component response regulator CbrB  36.11 
 
 
477 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3833  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.76 
 
 
450 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.859471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0659  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.98 
 
 
458 aa  106  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.63 
 
 
495 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1727  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.12 
 
 
482 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2549  putative regulatory protein  35.38 
 
 
475 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3541  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
1009 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2712  putative regulatory protein  35.38 
 
 
475 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349156  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0545  arginine utilization regulatory protein RocR  35.81 
 
 
467 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000949535  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2591  putative regulatory protein  35.38 
 
 
475 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.43464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  36.11 
 
 
478 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1522  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.87 
 
 
461 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>