More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2095 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  45.47 
 
 
865 aa  731    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.87 
 
 
858 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 
871 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 
872 aa  904    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 
858 aa  655    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  50.61 
 
 
873 aa  907    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 
872 aa  904    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  61.46 
 
 
892 aa  1132    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
932 aa  763    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  48.41 
 
 
858 aa  842    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  47.01 
 
 
882 aa  744    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  48.19 
 
 
850 aa  715    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  46.83 
 
 
853 aa  703    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  62.05 
 
 
892 aa  1133    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  61.6 
 
 
890 aa  1130    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  61.87 
 
 
894 aa  1130    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.17 
 
 
869 aa  725    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  61.39 
 
 
892 aa  1126    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 
872 aa  694    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  48.88 
 
 
869 aa  752    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 
900 aa  691    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  55.15 
 
 
881 aa  969    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 
868 aa  676    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  61.92 
 
 
892 aa  1129    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  46.57 
 
 
870 aa  774    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  74.09 
 
 
860 aa  1382    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  45.16 
 
 
867 aa  778    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 
862 aa  659    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  45.36 
 
 
872 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  62.05 
 
 
892 aa  1133    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  49.44 
 
 
863 aa  781    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  47.83 
 
 
896 aa  823    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.75 
 
 
863 aa  726    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  50.12 
 
 
873 aa  800    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 
891 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.16 
 
 
872 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  45.45 
 
 
868 aa  808    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  61.72 
 
 
892 aa  1134    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 
837 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 
880 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 
848 aa  643    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 
887 aa  719    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
872 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  45.88 
 
 
870 aa  797    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  61.74 
 
 
890 aa  1128    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 
882 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 
868 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.94 
 
 
870 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.12 
 
 
897 aa  781    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  62.4 
 
 
890 aa  1137    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 
910 aa  767    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
910 aa  761    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 
881 aa  674    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  44.75 
 
 
858 aa  671    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
903 aa  1843    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 
859 aa  716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 
868 aa  671    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  51.33 
 
 
840 aa  812    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  51.87 
 
 
857 aa  885    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  49.28 
 
 
854 aa  850    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  47.55 
 
 
852 aa  836    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  62.56 
 
 
895 aa  1150    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 
857 aa  676    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45 
 
 
889 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
854 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 
823 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
862 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 
861 aa  631  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 
885 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 
905 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 
903 aa  626  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
871 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 
874 aa  628  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 
853 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  45.17 
 
 
882 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 
882 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 
861 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
872 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
875 aa  625  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
871 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 
793 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 
874 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 
859 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 
888 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 
904 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
856 aa  622  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 
872 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 
855 aa  621  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 
853 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
854 aa  619  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
860 aa  619  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 
888 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 
892 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.17 
 
 
896 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
917 aa  617  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 
871 aa  618  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
861 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 
878 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 
882 aa  615  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
861 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>