More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2052 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  92.13 
 
 		 89 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  70.79 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  66.28 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  72.62 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  119  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  65.12 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  65.12 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>