More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2050 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 302 aa  607  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  77.48 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  60.26 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  60.26 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  60.26 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  60.26 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  60.93 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  60.26 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  59.93 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  59.93 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  59.93 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  59.93 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  60.47 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  46.51 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  46.51 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  44.66 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  47.41 
 
 		 280 aa  225  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  47.49 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  50.57 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  48.7 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  48.7 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  48.86 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  48.86 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  39.2 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  48.15 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  48.33 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  40.59 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  45.66 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  48.11 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  45.86 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  47.89 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  44.14 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  45.53 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  48.77 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  43.18 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  47.51 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  46.1 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  46.74 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  44.15 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  44.15 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  45.72 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  45.72 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  45.56 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  45.72 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  43.77 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  45.56 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  45.72 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  45.42 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  44.15 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  39.64 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  45.64 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  44.52 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  43.77 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  44.02 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  44.52 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  44.11 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  42.64 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  43.77 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  41.54 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  44.92 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  45.98 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  42.64 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  42.64 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  42.64 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  50.93 
 
 		 321 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  43.89 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.24 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1232  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  38.87 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  41.63 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  40 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  43.63 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  41.89 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  44.32 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  41.89 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  38.64 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  42.39 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  41.57 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  40.81 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  41.25 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  46.79 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>