More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2042 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.98 
 
 		 1442 aa  926    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  49.38 
 
 		 1367 aa  1180    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  49.26 
 
 		 1367 aa  1177    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  56.61 
 
 		 1436 aa  1670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  50.96 
 
 		 1397 aa  1358    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  80.89 
 
 		 483 aa  818    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  65.08 
 
 		 970 aa  1335    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  48.72 
 
 		 1390 aa  1135    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  50.99 
 
 		 1468 aa  1478    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1444 aa  2990    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  44.58 
 
 		 1465 aa  1031    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  86.07 
 
 		 1435 aa  2595    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  70.48 
 
 		 1433 aa  2147    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  57.09 
 
 		 1438 aa  1676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  70.55 
 
 		 1433 aa  2149    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  41.18 
 
 		 1493 aa  1105    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  70.27 
 
 		 1433 aa  2139    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  70.48 
 
 		 1433 aa  2147    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  56.87 
 
 		 1440 aa  1472    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  70.34 
 
 		 1433 aa  2146    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  71.32 
 
 		 1433 aa  2170    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  70.48 
 
 		 1433 aa  2147    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  49.13 
 
 		 1362 aa  1150    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  42.59 
 
 		 1479 aa  1119    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  56.69 
 
 		 1214 aa  998    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  54.95 
 
 		 1402 aa  1325    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  57.09 
 
 		 1438 aa  1676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  70.48 
 
 		 1433 aa  2147    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  70.06 
 
 		 1433 aa  2145    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  55.74 
 
 		 1449 aa  1405    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  55.82 
 
 		 1449 aa  1406    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  45.48 
 
 		 1365 aa  1068    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  54.28 
 
 		 1210 aa  994    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  50.94 
 
 		 1433 aa  1337    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  56.09 
 
 		 1212 aa  986    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  55.88 
 
 		 1635 aa  1429    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  48.29 
 
 		 1437 aa  1333    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  50.63 
 
 		 1432 aa  1471    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  51.25 
 
 		 1437 aa  1488    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  51.71 
 
 		 1464 aa  1510    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  55.76 
 
 		 1426 aa  1432    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  70.55 
 
 		 1433 aa  2151    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  55.76 
 
 		 1443 aa  1666    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  56.15 
 
 		 1407 aa  1390    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  37.66 
 
 		 1438 aa  933    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  48.44 
 
 		 1421 aa  1137    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  48.33 
 
 		 1527 aa  1174    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  46.86 
 
 		 1388 aa  1100    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  50.96 
 
 		 1447 aa  1238    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  49.26 
 
 		 1442 aa  1384    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 989 aa  622  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.42 
 
 		 1127 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  24.37 
 
 		 1176 aa  178  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 		 1167 aa  177  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.85 
 
 		 1170 aa  170  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  25.11 
 
 		 1130 aa  170  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1148 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.44 
 
 		 1170 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  23.8 
 
 		 1510 aa  166  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1165 aa  164  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  24.33 
 
 		 1139 aa  163  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  24 
 
 		 1184 aa  161  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.68 
 
 		 1157 aa  161  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.69 
 
 		 1156 aa  159  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  24.56 
 
 		 1178 aa  158  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 		 1155 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.68 
 
 		 1179 aa  157  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.93 
 
 		 1240 aa  155  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  23.83 
 
 		 1139 aa  155  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  24.27 
 
 		 1225 aa  155  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.03 
 
 		 1181 aa  153  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  25.08 
 
 		 1148 aa  152  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  25.07 
 
 		 1180 aa  152  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  24.59 
 
 		 1190 aa  152  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.9 
 
 		 1155 aa  152  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  23.17 
 
 		 1158 aa  152  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.77 
 
 		 1607 aa  152  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  23.21 
 
 		 1454 aa  151  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.26 
 
 		 1145 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  25.93 
 
 		 1145 aa  151  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 1476 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.54 
 
 		 1165 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  23.38 
 
 		 1171 aa  149  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.3 
 
 		 1170 aa  149  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  24.89 
 
 		 1160 aa  149  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  23.38 
 
 		 1171 aa  149  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  23.38 
 
 		 1160 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.39 
 
 		 1132 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22.16 
 
 		 1164 aa  148  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  23.87 
 
 		 1122 aa  147  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.5 
 
 		 1075 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  23.46 
 
 		 1177 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  22.99 
 
 		 1172 aa  146  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.72 
 
 		 1156 aa  146  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  50.67 
 
 		 560 aa  146  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.48 
 
 		 595 aa  144  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  39.52 
 
 		 584 aa  144  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  24.38 
 
 		 1160 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  24.38 
 
 		 1160 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.08 
 
 		 1122 aa  144  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>