More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2036 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  89.73 
 
 		 185 aa  334  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  273  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  69.19 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  68.11 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 184 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  58.06 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  58.15 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  62.22 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  58.01 
 
 		 184 aa  227  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  60 
 
 		 184 aa  227  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  61.71 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  58.56 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  58.47 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  55.38 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 187 aa  222  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  62.64 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  62.36 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  57.23 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 187 aa  207  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  53.23 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  57.38 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 184 aa  205  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 181 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 182 aa  202  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  52.69 
 
 		 186 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  52.15 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  53.01 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  52.57 
 
 		 182 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  54.86 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  54.34 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  51.08 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  52.51 
 
 		 182 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>