167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2029 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  100 
 
 
165 aa  329  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  71.17 
 
 
166 aa  245  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  48.45 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  48.43 
 
 
161 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  48.45 
 
 
162 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  47.4 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  46.58 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.91 
 
 
173 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  45.34 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  44.24 
 
 
163 aa  137  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.67 
 
 
162 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  39.26 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  49.32 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  47.83 
 
 
171 aa  130  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  42.14 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  46.67 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  43.83 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.26 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.46 
 
 
171 aa  123  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.2 
 
 
157 aa  120  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  47.2 
 
 
157 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.45 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.98 
 
 
159 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.21 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.18 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.16 
 
 
160 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  39.39 
 
 
162 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  36.02 
 
 
205 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.74 
 
 
154 aa  110  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.74 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  39.62 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  35.48 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  39.61 
 
 
157 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.01 
 
 
154 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.26 
 
 
151 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.51 
 
 
164 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.59 
 
 
220 aa  102  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.14 
 
 
137 aa  101  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  35.53 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  37.66 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  41.04 
 
 
161 aa  87.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.57 
 
 
163 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.18 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  35.17 
 
 
199 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  33.1 
 
 
209 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.48 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  42.03 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  36.48 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  32.68 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2125  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.15 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.56 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.38 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0669  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.3 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0620166  normal  0.293268 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3211  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.97 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192174  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  30.63 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.86 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2214  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 
206 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.985834  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  32.58 
 
 
210 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.38 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.38 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  34.19 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.99 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.2 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.12 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1885  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2362  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.33 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.45026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2147  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.46 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  34.13 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.07 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2116  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.62 
 
 
206 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.11 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1145  hypothetical protein  36.29 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.78 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2089  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.12 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.995215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  35.29 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.52 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.14 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.18 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.07 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.88 
 
 
271 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3692  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.08 
 
 
220 aa  74.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000909958  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.56 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  34.65 
 
 
209 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.1 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  29.81 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  36.29 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.88 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.5 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0335  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.56 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4375  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.33 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.893396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.09 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5611  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.72 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.414458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1076  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.71 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  38.69 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3103  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.99 
 
 
218 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.4 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.4 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>