More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2027 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  79.14 
 
 		 145 aa  220  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  49.31 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  46.62 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.26 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  41.96 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  40.43 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  45.26 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  43.07 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  45.11 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  44.44 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  41.84 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.16 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.6 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  43.7 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  43.7 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  42.54 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  40.94 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  39.86 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.39 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.39 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  37.32 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  43.07 
 
 		 136 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  37.41 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  41.61 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  41.48 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  36.88 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  37.14 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  37.14 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  36.42 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  38.97 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.5 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  38.03 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  40.6 
 
 		 183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.67 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  38.64 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.88 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  38.85 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.29 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  44.36 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  38.81 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  39.86 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  40.74 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.83 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  41.48 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  41.94 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  42.22 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  35.82 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  35.61 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.74 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  37.76 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  37.76 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  37.76 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.74 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  37.88 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.64 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  37.76 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.36 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  36.88 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  39.74 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.36 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.36 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  37.5 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.36 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.36 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.88 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  35.67 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  38.57 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  36.62 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.64 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  38.81 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.29 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.06 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.36 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  39.23 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  34.87 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  36.17 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  35.95 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>