79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1960 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
216 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  73.93 
 
 
215 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  49.77 
 
 
213 aa  222  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  49.77 
 
 
213 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  49.77 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  49.3 
 
 
213 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  49.3 
 
 
213 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  49.3 
 
 
213 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  48.83 
 
 
213 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  49.3 
 
 
213 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  49.3 
 
 
213 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  48.83 
 
 
213 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  47.89 
 
 
213 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  37.67 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  44.04 
 
 
213 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  44.04 
 
 
213 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  39.51 
 
 
211 aa  138  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  35.05 
 
 
216 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  36.36 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  35.48 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  33.94 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  31.96 
 
 
220 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  33.8 
 
 
209 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
209 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  31.89 
 
 
215 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  33.64 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  33.16 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  30.88 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  30.61 
 
 
212 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  25.81 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  28.64 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  27.55 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  30.66 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  28.04 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  31.38 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  29.86 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  32.71 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  29.11 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  27.7 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  29.1 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  25.7 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  26.23 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  31.07 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl224  hypothetical protein  25.89 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  28.64 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  28.74 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  26.55 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  37.86 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  30.3 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  29.59 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  25.14 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  26.24 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  30.21 
 
 
272 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  26.42 
 
 
234 aa  52  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  23.67 
 
 
204 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  25.5 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  26.53 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  27.56 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  29.17 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  29.17 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  27.45 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  25.56 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4260  thiamine pyrophosphokinase  29.82 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  32.97 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  27.49 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  27.67 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  27.27 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  31.15 
 
 
454 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  28.09 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  30.63 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 
212 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>