More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1938 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  100 
 
 		 678 aa  1387    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  47.04 
 
 		 2225 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  45.44 
 
 		 2224 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  45.44 
 
 		 2224 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  44.23 
 
 		 2221 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  48.52 
 
 		 2178 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  45.28 
 
 		 2224 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  44.23 
 
 		 765 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  48.94 
 
 		 2246 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  55.4 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  54.36 
 
 		 400 aa  313  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  56.27 
 
 		 382 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  32.63 
 
 		 2096 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  32.19 
 
 		 1271 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  31.02 
 
 		 1732 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1959 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  32.38 
 
 		 2942 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1600 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1352 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1840 aa  167  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1942 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1917 aa  161  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 2294 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  29.68 
 
 		 2349 aa  157  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1669 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.77 
 
 		 1485 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.6 
 
 		 3027 aa  151  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  30.58 
 
 		 1464 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1278  cell wall-associated protein  62.5 
 
 		 258 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.57 
 
 		 1008 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.57 
 
 		 1008 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  29.62 
 
 		 765 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.84 
 
 		 1467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 927 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.97 
 
 		 1599 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.16 
 
 		 3193 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.88 
 
 		 2003 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  29.41 
 
 		 1345 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  29.41 
 
 		 1345 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 		 2035 aa  143  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  38.03 
 
 		 2658 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  40.87 
 
 		 396 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.2 
 
 		 1560 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.86 
 
 		 1572 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1181  wall-associated protein  52.99 
 
 		 241 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.24 
 
 		 1586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.38 
 
 		 903 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.24 
 
 		 1595 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 		 869 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1135  wall-associated protein  61.21 
 
 		 260 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  29.29 
 
 		 2731 aa  134  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.17 
 
 		 2149 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 3689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.75 
 
 		 1953 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 690 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.04 
 
 		 1384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1147 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.62 
 
 		 889 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.79 
 
 		 2277 aa  127  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 2486 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.69 
 
 		 1576 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1550 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1025  wall-associated domain-containing protein  55.56 
 
 		 250 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1623 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1611 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 3273 aa  123  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1558 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.98 
 
 		 741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  29.71 
 
 		 1427 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.85 
 
 		 1381 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 2831 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 3073 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 2961 aa  119  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  27.22 
 
 		 902 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.12 
 
 		 764 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  27.08 
 
 		 1998 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.29 
 
 		 1160 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1138  wall-associated protein  60 
 
 		 106 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.659676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  34.9 
 
 		 1681 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1081 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.76 
 
 		 788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.23 
 
 		 705 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.76 
 
 		 788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1935 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1419 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1487 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1400 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1090 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1149 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 2374 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.35 
 
 		 1385 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  22.9 
 
 		 1517 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  32.27 
 
 		 423 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.16 
 
 		 924 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1494 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>