More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1782 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
389 aa  740    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  55.38 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  55.38 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  55.38 
 
 
387 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  55.65 
 
 
387 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  55.38 
 
 
387 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  55.38 
 
 
387 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  55.65 
 
 
387 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  55.11 
 
 
387 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  55.38 
 
 
387 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  54.84 
 
 
387 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  54.84 
 
 
385 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  55.23 
 
 
375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  55.23 
 
 
375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  53.62 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  53.62 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  53.62 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  53.62 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  53.62 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  53.62 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  53.89 
 
 
375 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  53.89 
 
 
375 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  53.89 
 
 
375 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  42.51 
 
 
382 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  36.81 
 
 
375 aa  256  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 
445 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  36.73 
 
 
379 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  44.47 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  41.15 
 
 
399 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.04 
 
 
352 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.36 
 
 
386 aa  231  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 
396 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  40.37 
 
 
412 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  41.34 
 
 
399 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 
416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  33.75 
 
 
423 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.94 
 
 
418 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
399 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  35.96 
 
 
395 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
404 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 
748 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 
749 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
392 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  35.22 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  32.36 
 
 
412 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  34.7 
 
 
398 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
467 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
467 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 
413 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.68 
 
 
427 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  40.05 
 
 
413 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
453 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  39.63 
 
 
415 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 
397 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.44 
 
 
424 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
388 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 
756 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  30.08 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 
469 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 
388 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
386 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  32.59 
 
 
320 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 
385 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 
423 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 
414 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 
586 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 
462 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 
473 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 
402 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
586 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
586 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 
586 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 
587 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  30.86 
 
 
764 aa  146  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 
425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
587 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
390 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.32 
 
 
585 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  29.14 
 
 
701 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.32 
 
 
587 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.05 
 
 
585 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 
485 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 
474 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
460 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  29.25 
 
 
767 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  29.7 
 
 
479 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 
388 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
387 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  29.43 
 
 
650 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  32.57 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
585 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  30.39 
 
 
584 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>