More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1754 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 474 aa  929    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  57.2 
 
 		 474 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  56.99 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  56.99 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  57.2 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  56.99 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  56.99 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  57.45 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  56.8 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  55.41 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  56.26 
 
 		 456 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  56.26 
 
 		 456 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  53.12 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  53.33 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  52.69 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  52.9 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  52.7 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  52.69 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  52.9 
 
 		 465 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  52.9 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  52.48 
 
 		 465 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  52.47 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1782  amino acid permease-associated region  48.41 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0537  amino acid permease-associated region  50.64 
 
 		 474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  36.99 
 
 		 472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  40.79 
 
 		 480 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 		 471 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  37.68 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  38.69 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  38.72 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  37.76 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  37.76 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  37.55 
 
 		 471 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  38.54 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  37.9 
 
 		 475 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  38.22 
 
 		 475 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  37.71 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  35.22 
 
 		 468 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  37.12 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  37.5 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  37.18 
 
 		 471 aa  246  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  36.62 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  37.39 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  37.71 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  37.27 
 
 		 506 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  37.05 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  37.05 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  37.05 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  37.05 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  36.77 
 
 		 475 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  37.27 
 
 		 506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  37.05 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  37.2 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  37.18 
 
 		 475 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  34.33 
 
 		 475 aa  242  9e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  36.99 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 475 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  34.33 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  38.46 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  38.3 
 
 		 475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  35.91 
 
 		 484 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  37.67 
 
 		 482 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 		 445 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  37.67 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  36.56 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  34.3 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  36.62 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  35.78 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  34.72 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  35.48 
 
 		 493 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  38.95 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  35.93 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  35.93 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  35.93 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  32.91 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  32.91 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  37.55 
 
 		 475 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  36.72 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  37.42 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  35.4 
 
 		 493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  36.29 
 
 		 496 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  36.29 
 
 		 671 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  34.73 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  36.29 
 
 		 663 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  32.75 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  34.52 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  34.52 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>