More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1730 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
415 aa  806    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  55.1 
 
 
409 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  56.02 
 
 
432 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  56.02 
 
 
432 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  55.14 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  54.86 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  56.02 
 
 
409 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  54.55 
 
 
409 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  43 
 
 
404 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  42.57 
 
 
474 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
439 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 
400 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  34.79 
 
 
406 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1846  transporter protein  55.49 
 
 
229 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.958956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2610  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
407 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 
397 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1847  transporter protein  55.48 
 
 
188 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
385 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
387 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.06 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
415 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  32.74 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.44 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.54 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  28.53 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  29.14 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  28.53 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  20.71 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  34.21 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  21.07 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  23.76 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  27.76 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  21.45 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.07 
 
 
394 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  27.32 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  20.85 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  29.55 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  20.58 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  20.58 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.09 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4363  major facilitator transporter  35.51 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  26.17 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  24.29 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  27.81 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  20.68 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.12 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.5 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.75 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  20.6 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.45 
 
 
541 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24.78 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  33.87 
 
 
513 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  20.56 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  29.45 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  31.21 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  28.49 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.04 
 
 
538 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.37 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  24.82 
 
 
494 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  26.53 
 
 
455 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  31.73 
 
 
561 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.63 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.22 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  25.96 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  28.16 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  31.4 
 
 
452 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  26.48 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  26.26 
 
 
395 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  20.6 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  24.93 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  24 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
521 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.07 
 
 
386 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.78 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
521 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
502 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
491 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 
478 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
392 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  32.61 
 
 
478 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
561 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>