131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1712 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  70.9 
 
 
250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  50.2 
 
 
253 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  46.25 
 
 
253 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  47.11 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  47.11 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  38.24 
 
 
254 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  38.24 
 
 
254 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  39.06 
 
 
256 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  37.66 
 
 
260 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  38.67 
 
 
256 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  36.55 
 
 
254 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  34.17 
 
 
251 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  36.13 
 
 
256 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  32.64 
 
 
260 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  34.96 
 
 
250 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  36.55 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  34.57 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  35.27 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  28.69 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  28.98 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  26.53 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  32.9 
 
 
251 aa  92  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  27.09 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  28.05 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  28.05 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  28.46 
 
 
279 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  27.09 
 
 
277 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  27.09 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  27.09 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  27.09 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  27.09 
 
 
277 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  28.46 
 
 
273 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  27.09 
 
 
256 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  27.09 
 
 
274 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  27.09 
 
 
277 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  27.64 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  26.02 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  27.2 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  25.71 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  25.31 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  26.21 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  27.2 
 
 
529 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  24.9 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  24.9 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  24.9 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  26.23 
 
 
410 aa  75.1  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  28.33 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  28.33 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  28.33 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  26.51 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  27.35 
 
 
555 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.77 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  25.53 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  27.16 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  25.32 
 
 
467 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  30.49 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  26 
 
 
468 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  25.2 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  23.91 
 
 
408 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  23.39 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  25.2 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  24.28 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  24.6 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  26.03 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.98 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  24.35 
 
 
408 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  24.32 
 
 
466 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  23.55 
 
 
473 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.81 
 
 
406 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  24 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  24 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.4 
 
 
406 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.4 
 
 
406 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.4 
 
 
406 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  24.6 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  24.6 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.2 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  23.4 
 
 
406 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  24 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  23.41 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  23.72 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  24.9 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.14 
 
 
422 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.32 
 
 
406 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  26.14 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.62 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.89 
 
 
406 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  23.9 
 
 
259 aa  55.5  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  22.92 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  22.8 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.18 
 
 
411 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  21.9 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.58 
 
 
419 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>