More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1673 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  72.38 
 
 		 484 aa  727    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 493 aa  1019    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  72.96 
 
 		 479 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  72.23 
 
 		 484 aa  729    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  55.35 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  56.36 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  51.53 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  51.53 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  51.36 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  51.98 
 
 		 530 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  51.8 
 
 		 530 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  49.71 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  49.13 
 
 		 529 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  49.71 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  48.01 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  49.32 
 
 		 529 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  49.13 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  42.66 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  43.14 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  43.51 
 
 		 499 aa  355  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  42.54 
 
 		 486 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  41.75 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  41.32 
 
 		 495 aa  349  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  43.37 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  42.53 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  41.61 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  41.93 
 
 		 477 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  38.36 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  45.1 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  45.1 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  31.14 
 
 		 503 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  30.98 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  30.16 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  31.46 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  29.62 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  31.87 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  31.65 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  32.32 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  32.11 
 
 		 500 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  30.63 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  34.25 
 
 		 489 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  31.64 
 
 		 493 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  31.46 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  30.93 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  31.96 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  32.34 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  32.91 
 
 		 489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  32.64 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  29.8 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  30.92 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  33.75 
 
 		 489 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  29.89 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.3 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  30.28 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  30.21 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  32.15 
 
 		 489 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  29.03 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  29.54 
 
 		 506 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  30.21 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  31.63 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  32.24 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  29.36 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  27.58 
 
 		 571 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  29.51 
 
 		 484 aa  156  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  29.27 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.84 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  29.75 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  28.72 
 
 		 710 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  30.48 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  30.15 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.65 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  30.15 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  27.77 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  27.23 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.18 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  35.48 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  29.85 
 
 		 489 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  32.81 
 
 		 484 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  28.14 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.1 
 
 		 703 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  31.13 
 
 		 834 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 553 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  28.61 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  31.53 
 
 		 775 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 		 553 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  32.66 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  29.36 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  33.02 
 
 		 545 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  25.8 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.37 
 
 		 498 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  35.62 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  30.73 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.16 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  31.88 
 
 		 846 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>