More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1630 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  92.38 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  80.29 
 
 		 212 aa  353  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  81.73 
 
 		 212 aa  352  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  79.81 
 
 		 215 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  79.81 
 
 		 212 aa  351  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  79.33 
 
 		 212 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  68.57 
 
 		 211 aa  307  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  68.57 
 
 		 211 aa  307  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  68.42 
 
 		 217 aa  299  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  68.1 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  66.34 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  61.95 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  61.95 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  64.36 
 
 		 223 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  62.02 
 
 		 208 aa  260  8.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  59.61 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  56.57 
 
 		 267 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  57.75 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  41.79 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  41.79 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  41.79 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  41.29 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.29 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  41.29 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.29 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  41.29 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  41.79 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.8 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  40.3 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  41.58 
 
 		 271 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  40.31 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  39.15 
 
 		 277 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  39.58 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  38.67 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  37.3 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  37.1 
 
 		 274 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  36.6 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.43 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  35.75 
 
 		 313 aa  138  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  35.83 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  37.91 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  36.13 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  35.94 
 
 		 261 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  37.7 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  34.59 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  35.83 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.81 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.69 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.69 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  35.1 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  34.44 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.97 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  34.27 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  29 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  31.05 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  29.22 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.79 
 
 		 716 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  30.72 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  34.88 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  36.17 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  28.18 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 		 705 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  33.33 
 
 		 705 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  29.38 
 
 		 542 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.5 
 
 		 705 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  26.8 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  26.06 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  29.06 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  31.54 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  25.95 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.51 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.15 
 
 		 750 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  31.78 
 
 		 714 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  32 
 
 		 342 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1758  GTP diphosphokinase, RelA/SpoT protein  32.5 
 
 		 722 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  27.52 
 
 		 740 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.74 
 
 		 574 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  32.72 
 
 		 1046 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  28.8 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2856  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.41 
 
 		 749 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0013983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1398  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.89 
 
 		 739 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000892312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1358  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.89 
 
 		 739 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0562025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  31.25 
 
 		 340 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  30 
 
 		 714 aa  52.4  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.58 
 
 		 751 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1533  RelA/SpoT family protein  31.67 
 
 		 714 aa  52.4  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000577209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02629  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  32.5 
 
 		 744 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000829976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.5 
 
 		 744 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02591  hypothetical protein  32.5 
 
 		 744 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000104096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.5 
 
 		 744 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000016084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4044  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.5 
 
 		 744 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000409177  normal  0.332873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3088  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.5 
 
 		 744 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000221392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  28.67 
 
 		 366 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>