More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1627 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  61.85 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  59.7 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  56.15 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  56.52 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  55.08 
 
 		 280 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  60 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  57.85 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  58.33 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  57.72 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  59.66 
 
 		 189 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  56.2 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  61.61 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  54.69 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  58.27 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  59.35 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  57.48 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  58.2 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.48 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  57.48 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  55.38 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  58.68 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  56.25 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  56.25 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  56.25 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  49.19 
 
 		 273 aa  141  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 		 305 aa  141  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  57.02 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  52 
 
 		 281 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.61 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  58.2 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  56.69 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  56.69 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  56.69 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.81 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  52.42 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  56.25 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  61.61 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.69 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  54.69 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  51.91 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  57.63 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  49.6 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  52.71 
 
 		 146 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 438 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  53.17 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  53.44 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  49.28 
 
 		 300 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  43.5 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  49.62 
 
 		 362 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  56.78 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  60 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  57.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  49.03 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  55.08 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  55.08 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  49.67 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  56.9 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  52.99 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.36 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  54.24 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  55 
 
 		 326 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  55.83 
 
 		 329 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  51.69 
 
 		 442 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  51.67 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  51.61 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  50 
 
 		 261 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  50 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  49.14 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  52.85 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  55.96 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  51.08 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  49.14 
 
 		 174 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  52.94 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  48.28 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  41.45 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  53.39 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  51.97 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  48 
 
 		 263 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  54.24 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  50.83 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  53.91 
 
 		 368 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.14 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  55.96 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  50.39 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3765  lytic transglycosylase, catalytic  46.25 
 
 		 326 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  48.78 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  47.24 
 
 		 354 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>