More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1592 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.64 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.64 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.64 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 230 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.64 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.64 
 
 		 226 aa  288  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.19 
 
 		 230 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.64 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.19 
 
 		 230 aa  287  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.2 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1579  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.88 
 
 		 136 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.44 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.89 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.46 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.9 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.46 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.37 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.68 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.81 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.8 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.97 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.92 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.57 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.45 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.45 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.32 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.27 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.34 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.81 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1971  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 352 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.26 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.98 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.66 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.53 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2539  cAMP-binding protein - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinase  30 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000419866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  28.21 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  29.02 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  28.86 
 
 		 352 aa  89  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.02 
 
 		 251 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 355 aa  88.2  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>