More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1523 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  38.89 
 
 		 1227 aa  767    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  38.89 
 
 		 1227 aa  767    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  40 
 
 		 1235 aa  802    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  40.08 
 
 		 1235 aa  804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  41.11 
 
 		 1237 aa  834    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  39.08 
 
 		 1287 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  39.98 
 
 		 1228 aa  819    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.86 
 
 		 1132 aa  1537    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  38.36 
 
 		 1230 aa  783    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  38.01 
 
 		 1261 aa  732    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  38.76 
 
 		 1244 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.33 
 
 		 1239 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.77 
 
 		 1132 aa  1534    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.77 
 
 		 1133 aa  1532    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.86 
 
 		 1133 aa  1536    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  39.2 
 
 		 1239 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  39.05 
 
 		 1271 aa  799    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  39.2 
 
 		 1220 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  41.43 
 
 		 1158 aa  822    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  38.62 
 
 		 1182 aa  778    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  37.84 
 
 		 1188 aa  758    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  38.15 
 
 		 1244 aa  793    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  39.01 
 
 		 1237 aa  769    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  39.18 
 
 		 1290 aa  737    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  42.29 
 
 		 1178 aa  840    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  39.03 
 
 		 1257 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  40.35 
 
 		 1232 aa  822    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  39.72 
 
 		 1236 aa  793    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  38.01 
 
 		 1261 aa  731    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  39.3 
 
 		 1264 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  38.42 
 
 		 1272 aa  798    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  40.64 
 
 		 1236 aa  815    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  41.34 
 
 		 1225 aa  803    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.68 
 
 		 1208 aa  803    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  40.03 
 
 		 1224 aa  788    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  41.79 
 
 		 1208 aa  845    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  38.06 
 
 		 1233 aa  786    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  39.6 
 
 		 1226 aa  806    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  38.54 
 
 		 1239 aa  799    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.77 
 
 		 1132 aa  1534    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.3 
 
 		 1163 aa  780    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  37.96 
 
 		 1188 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  41.05 
 
 		 1190 aa  818    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  40.68 
 
 		 1267 aa  830    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  39.42 
 
 		 1182 aa  765    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  38.87 
 
 		 1192 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  40.46 
 
 		 1171 aa  777    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  40.37 
 
 		 1150 aa  756    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  37.47 
 
 		 1259 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  39.45 
 
 		 1304 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  37.93 
 
 		 1188 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  37.25 
 
 		 1245 aa  748    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  38.62 
 
 		 1233 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  39.18 
 
 		 1286 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  39.41 
 
 		 1262 aa  827    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  39.04 
 
 		 1230 aa  785    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  38.46 
 
 		 1251 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  39.45 
 
 		 1214 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  40.53 
 
 		 1149 aa  734    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  39.65 
 
 		 1241 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  40.18 
 
 		 1293 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  39.33 
 
 		 1245 aa  799    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  38.85 
 
 		 1261 aa  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  39.13 
 
 		 1271 aa  785    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  37.23 
 
 		 1187 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  39.41 
 
 		 1234 aa  783    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  38.98 
 
 		 1271 aa  772    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  40.51 
 
 		 1226 aa  766    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  38.22 
 
 		 1227 aa  776    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  38.04 
 
 		 1240 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  37.73 
 
 		 1252 aa  727    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  38.31 
 
 		 1244 aa  787    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  39.34 
 
 		 1220 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  38.5 
 
 		 1264 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  39.6 
 
 		 1208 aa  795    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  40.76 
 
 		 1197 aa  835    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  39.14 
 
 		 1224 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  38.48 
 
 		 1244 aa  789    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  38.65 
 
 		 1244 aa  792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  39.92 
 
 		 1245 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  38.22 
 
 		 1238 aa  775    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  41.13 
 
 		 1176 aa  833    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  64.53 
 
 		 1132 aa  1535    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  39.49 
 
 		 1167 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  39.6 
 
 		 1226 aa  819    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  39.41 
 
 		 1234 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  38.68 
 
 		 1216 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  38.62 
 
 		 1182 aa  779    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  38.15 
 
 		 1263 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  39.82 
 
 		 1220 aa  768    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  38.48 
 
 		 1244 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  42.18 
 
 		 1158 aa  832    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  39.39 
 
 		 1254 aa  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  39.47 
 
 		 1249 aa  793    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  39.01 
 
 		 1250 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  38.27 
 
 		 1244 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  38.39 
 
 		 1246 aa  782    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  39.3 
 
 		 1264 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  39.44 
 
 		 1227 aa  817    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  39.15 
 
 		 1251 aa  755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>