More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1506 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  100 
 
 		 450 aa  895    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  70.44 
 
 		 450 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  50.88 
 
 		 456 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  44.22 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  43.54 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  43.31 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  42.79 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  43.08 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  43.08 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  43.08 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  43.08 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  43.08 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  43.48 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  42.86 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  41.93 
 
 		 463 aa  359  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  41.42 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  40.32 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  39.4 
 
 		 446 aa  309  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  35.78 
 
 		 439 aa  300  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  38.99 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  38.9 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  39.05 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  39.28 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  39.02 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  39.02 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  39 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  38.8 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  38.78 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  35.09 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  34.17 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  34.47 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  32.05 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.65 
 
 		 555 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  31.85 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  30.11 
 
 		 458 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  32.24 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.33 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.33 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  27.71 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  27.11 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  27.53 
 
 		 484 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.53 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  27.31 
 
 		 495 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.35 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  28.35 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 502 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  28.73 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  28.6 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  28 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  29.53 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  28.98 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  27.88 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  27.75 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  26.21 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 486 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  26.1 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  28.31 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 459 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  26.4 
 
 		 458 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  21.49 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  25.05 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  25.34 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  25.35 
 
 		 477 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  24.07 
 
 		 446 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  25.35 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  23.76 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>