More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1486 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  35.49 
 
 		 1218 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  40.09 
 
 		 1392 aa  835    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  33.09 
 
 		 1377 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  54.44 
 
 		 1241 aa  1327    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  35.65 
 
 		 1217 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  54.36 
 
 		 1241 aa  1318    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  54.2 
 
 		 1241 aa  1318    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  54.28 
 
 		 1241 aa  1318    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  68.75 
 
 		 1244 aa  1724    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  44.44 
 
 		 1230 aa  909    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  42.26 
 
 		 1233 aa  901    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  35.65 
 
 		 1217 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  36.34 
 
 		 1282 aa  787    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  53.99 
 
 		 1242 aa  1306    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  54.36 
 
 		 1241 aa  1318    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  54.28 
 
 		 1241 aa  1322    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  40.8 
 
 		 1405 aa  826    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  42.23 
 
 		 1251 aa  949    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  38.93 
 
 		 1248 aa  871    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  54.36 
 
 		 1240 aa  1314    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  100 
 
 		 1242 aa  2517    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  54.44 
 
 		 1241 aa  1326    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  53.88 
 
 		 1241 aa  1313    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.22 
 
 		 1271 aa  897    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  39.86 
 
 		 1270 aa  899    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  54.24 
 
 		 1241 aa  1317    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  38.03 
 
 		 1236 aa  784    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  44.98 
 
 		 1244 aa  1035    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.83 
 
 		 1230 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  32.67 
 
 		 1204 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.57 
 
 		 1186 aa  577  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  34.4 
 
 		 1392 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  29.72 
 
 		 1217 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  29.86 
 
 		 1207 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  33.31 
 
 		 1240 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 1121 aa  445  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.06 
 
 		 1203 aa  386  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.71 
 
 		 1226 aa  205  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 1149 aa  205  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 		 1123 aa  176  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 1080 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 1074 aa  160  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 1165 aa  157  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1057 aa  155  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  28.69 
 
 		 1184 aa  154  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3878  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 		 1111 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.36 
 
 		 1125 aa  149  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 1121 aa  147  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  29.49 
 
 		 1111 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 1115 aa  147  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 1147 aa  145  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.24 
 
 		 1155 aa  145  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 1196 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  23.78 
 
 		 1124 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.18 
 
 		 1180 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  27.24 
 
 		 1156 aa  142  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  26.71 
 
 		 1183 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 		 1161 aa  142  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4021  UvrD/REP helicase  29.9 
 
 		 1111 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  25.87 
 
 		 1180 aa  142  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1061 aa  140  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.41 
 
 		 1177 aa  140  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 1110 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.8 
 
 		 1173 aa  140  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 1290 aa  138  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.21 
 
 		 1089 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1107 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 1095 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.29 
 
 		 1139 aa  130  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.39 
 
 		 1168 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 1061 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 1124 aa  128  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 		 1130 aa  126  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 1164 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 1019 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 787 aa  125  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2400  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 1194 aa  124  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 1087 aa  124  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 1110 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1177 aa  121  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  27.61 
 
 		 1180 aa  121  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.61 
 
 		 860 aa  121  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  25.68 
 
 		 1161 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.46 
 
 		 678 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 1185 aa  119  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.87 
 
 		 1155 aa  119  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  21.37 
 
 		 854 aa  119  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 		 732 aa  119  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.88 
 
 		 755 aa  118  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  28.59 
 
 		 1165 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  26.71 
 
 		 1166 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  27.46 
 
 		 1183 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 1168 aa  116  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  27.63 
 
 		 728 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  27.63 
 
 		 728 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.4 
 
 		 768 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  22.66 
 
 		 1054 aa  115  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 744 aa  115  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  26.95 
 
 		 726 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.36 
 
 		 773 aa  114  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>