More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1480 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  72.01 
 
 		 434 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  72.36 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  72 
 
 		 434 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  73.44 
 
 		 443 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  85.27 
 
 		 425 aa  772    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  770    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  770    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  770    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  77.57 
 
 		 427 aa  684    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  75.3 
 
 		 428 aa  670    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  74.34 
 
 		 429 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  73.44 
 
 		 428 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  72.38 
 
 		 431 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 475 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  75.3 
 
 		 1110 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  71.88 
 
 		 435 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  76.03 
 
 		 1111 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  80.76 
 
 		 426 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  769    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  770    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  76.35 
 
 		 1111 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  72.01 
 
 		 434 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  73.79 
 
 		 492 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  769    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  73.73 
 
 		 422 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  100 
 
 		 428 aa  883    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 475 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  770    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  75.89 
 
 		 430 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  72.47 
 
 		 431 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  76.63 
 
 		 443 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  76.01 
 
 		 426 aa  676    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  72.84 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  84.56 
 
 		 425 aa  765    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  74.7 
 
 		 430 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  85.04 
 
 		 425 aa  770    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  73.1 
 
 		 428 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  76.27 
 
 		 1111 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  72.36 
 
 		 435 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  84.56 
 
 		 425 aa  766    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  74.52 
 
 		 433 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  96.03 
 
 		 428 aa  857    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 435 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  72.29 
 
 		 432 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  71.88 
 
 		 434 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  71.63 
 
 		 429 aa  630  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  71.63 
 
 		 434 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  72.36 
 
 		 429 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  72.42 
 
 		 431 aa  624  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  72.14 
 
 		 430 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  72.29 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  70.43 
 
 		 438 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  71.91 
 
 		 429 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03887  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1558  isocitrate lyase  72.4 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  68.51 
 
 		 434 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0451  isocitrate lyase  68.97 
 
 		 436 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  69.93 
 
 		 432 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  68.74 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5485  isocitrate lyase  68.97 
 
 		 434 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  73.28 
 
 		 461 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  68.51 
 
 		 434 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1614  isocitrate lyase  72.15 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.642543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  70.02 
 
 		 422 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  68.51 
 
 		 434 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  68.51 
 
 		 434 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  68.88 
 
 		 443 aa  611  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  68.51 
 
 		 434 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  69.28 
 
 		 435 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0366  isocitrate lyase  68.59 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0405  isocitrate lyase  71.01 
 
 		 429 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3957  isocitrate lyase  68.82 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  70.24 
 
 		 435 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  67.29 
 
 		 432 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0816  isocitrate lyase  70.94 
 
 		 429 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.745785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3930  isocitrate lyase  70.94 
 
 		 429 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  68.08 
 
 		 439 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  72.26 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  67.9 
 
 		 450 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0373  isocitrate lyase  71.19 
 
 		 429 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432855  hitchhiker  0.00124435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  67.36 
 
 		 434 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  68.6 
 
 		 439 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  69.6 
 
 		 435 aa  602  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4502  isocitrate lyase  67.67 
 
 		 435 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  68.31 
 
 		 439 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  67.83 
 
 		 440 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>