19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1478 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 101 aa  191  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  68.69 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  36.67 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  36.05 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  39.51 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  43.08 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  35.23 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  38.98 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0943  branched-chain amino acid transport  40.23 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000713443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  34.04 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2544  branched-chain amino acid transport  28 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000678666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>