More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1475 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  85.17 
 
 
264 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  75.76 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  61.36 
 
 
263 aa  317  9e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  57.58 
 
 
265 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  55.51 
 
 
264 aa  298  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  57.95 
 
 
262 aa  295  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 
265 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  54.75 
 
 
264 aa  286  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  54.55 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  55.68 
 
 
264 aa  285  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  50.19 
 
 
265 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  49.06 
 
 
265 aa  275  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  54.72 
 
 
265 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  52.65 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  51.14 
 
 
264 aa  271  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.76 
 
 
264 aa  271  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
261 aa  268  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  52.96 
 
 
264 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
264 aa  267  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  53.61 
 
 
264 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
267 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  47.41 
 
 
257 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  52.21 
 
 
282 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  52.09 
 
 
264 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  52.09 
 
 
264 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  51 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  51 
 
 
270 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
267 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  54.75 
 
 
263 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
267 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
264 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  50.95 
 
 
264 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  50.95 
 
 
264 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  50.57 
 
 
264 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  51.74 
 
 
265 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
262 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  50.57 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  51.33 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  50.95 
 
 
264 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 
264 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  49.03 
 
 
264 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  49.81 
 
 
264 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
264 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
264 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  49.81 
 
 
264 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  48.26 
 
 
264 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  49.03 
 
 
264 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  49.24 
 
 
296 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 
264 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 
264 aa  236  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  47.35 
 
 
264 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49 
 
 
254 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  49.61 
 
 
264 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.61 
 
 
256 aa  224  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
252 aa  221  8e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  44.58 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  42.52 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
253 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.49 
 
 
251 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  42.73 
 
 
242 aa  188  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
325 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  35.29 
 
 
250 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  34.51 
 
 
370 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  37.5 
 
 
252 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
223 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
223 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.63 
 
 
281 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
223 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
223 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
223 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
375 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 
385 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
223 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  32.46 
 
 
350 aa  122  8e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
223 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  34.48 
 
 
223 aa  121  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 
385 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 
385 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  33.88 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  36.16 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>