More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1441 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 474 aa  977    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  33.58 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  33.75 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  38.51 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 450 aa  99.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.16 
 
 		 477 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 476 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 728 aa  93.2  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  33.95 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.33 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.63 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  21.45 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.41 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.45 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  31.48 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  32.52 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  31.54 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  31.54 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 391 aa  67  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 418 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 407 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  29.38 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.87 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  28.81 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  29.38 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  29.38 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  26.75 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.7 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>