More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1398 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  100 
 
 
106 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  68.87 
 
 
106 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  68.87 
 
 
106 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  62.75 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  59.62 
 
 
104 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  59.05 
 
 
110 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  55.66 
 
 
106 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  57.94 
 
 
108 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  55.34 
 
 
105 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  57.28 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  53.85 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  56.44 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  57.28 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.37 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.37 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 
153 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  55.66 
 
 
106 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  58.42 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  50.96 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  53.77 
 
 
106 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  55.45 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  57.43 
 
 
104 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  54.72 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  54.72 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  58.42 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 
106 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  57.43 
 
 
105 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 
104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 
107 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  52.83 
 
 
106 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  50 
 
 
106 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  50 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  50 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  50 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 
105 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  48.11 
 
 
106 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  49.02 
 
 
108 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  47.12 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  47.12 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 
104 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 
105 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  57.47 
 
 
104 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  48.08 
 
 
104 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  53 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  50 
 
 
105 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  53 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 
105 aa  104  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  50 
 
 
104 aa  104  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  54.21 
 
 
107 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 
109 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 
106 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 
106 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  51.4 
 
 
107 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 
107 aa  103  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  50 
 
 
106 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  56.32 
 
 
104 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  55.45 
 
 
105 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 
106 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 
104 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  45.37 
 
 
114 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 
104 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  48.08 
 
 
105 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  50 
 
 
106 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 
105 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 
106 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 
104 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 
104 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  50 
 
 
105 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  50.48 
 
 
105 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 
108 aa  100  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 
105 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 
104 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>