More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1252 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 551 aa  1135    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  75.68 
 
 		 552 aa  885    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  43.19 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  43.25 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  42.06 
 
 		 552 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.65 
 
 		 568 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  40.65 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  41.13 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  41.17 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  41.4 
 
 		 575 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  43.49 
 
 		 543 aa  412  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  42.36 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  41.47 
 
 		 564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  44.51 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  41.19 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  43.12 
 
 		 566 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  41.26 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  41.13 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  42.75 
 
 		 581 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  44.26 
 
 		 560 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  40.76 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  40.88 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 559 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  41.53 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  42.1 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  41.26 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  41.39 
 
 		 582 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  39.7 
 
 		 556 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  40.72 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  40.61 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  41.25 
 
 		 567 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  40.93 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  41.32 
 
 		 564 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  41.79 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  41.79 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  41.79 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  41.42 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  41.79 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  41.79 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  41.79 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  41.27 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  41.61 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  40.9 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  41.64 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  41.56 
 
 		 572 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  41.64 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  41.49 
 
 		 567 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.8 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  41.67 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  40.47 
 
 		 574 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  40.11 
 
 		 567 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  41.41 
 
 		 567 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  41.27 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  40.37 
 
 		 570 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  41.09 
 
 		 567 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  41.64 
 
 		 567 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  40.91 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 572 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.69 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  41.05 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  40.18 
 
 		 567 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  40.18 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  38.1 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  39.31 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  39.43 
 
 		 538 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  38.31 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  36.85 
 
 		 551 aa  332  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.39 
 
 		 561 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.08 
 
 		 554 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 565 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.52 
 
 		 587 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 		 587 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.38 
 
 		 560 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 		 587 aa  309  9e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.67 
 
 		 572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.35 
 
 		 553 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.2 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.5 
 
 		 557 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.78 
 
 		 557 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 		 587 aa  306  7e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  33.58 
 
 		 566 aa  306  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.08 
 
 		 561 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  34.8 
 
 		 566 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.03 
 
 		 573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.21 
 
 		 566 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.97 
 
 		 572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.34 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.27 
 
 		 567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.85 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.1 
 
 		 604 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.27 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.52 
 
 		 535 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  32.34 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.34 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  32.34 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.34 
 
 		 574 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.49 
 
 		 572 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>